济宁医学院公共卫生学院的前身为济宁医学院预防医学系，建于1985年，是我校最早设置的两个专业教学单位之一，也是山东省最早开设预防医学专业的学院之一。1987开始招收预防医学专业本科生。1994年成立职业卫生与环境医学实验室，该实验室于1996年被批准为山东省高校“九五”重点建设实验室，为山东省唯一以职业卫生与环境医学为研究方向的省级重点实验室。2003年新上医学检验专业（卫生检验方向）。2007年预防医学系更名为公共卫生学院。同年，预防医学专业被评为山东省高等学校特色专业和成人高等教育品牌专业。2008年预防医学专业成为学校首个国家特色专业建设点。2010年新上食品质量与安全专业。2011年学院实验中心被评为山东省实验教学示范中心。2012年预防医学专业教学团队被评为山东省优秀教学团队，学院同时被列为山东省高等学校人才培养模式创新实验区。2015年预防医学专业获得山东省省属普通本科高校应用型人才培养专业发展支持计划。2018年卫生检验与检疫专业回归到公共卫生学院。2019年预防医学专业被评为山东省一流专业；2021年卫生检验检疫专业被评为山东省一流专业。2026年公共卫生学院被评为山东省公共卫生特色学院。

学院现拥有预防医学、卫生检验与检疫等2个本科专业，设有12个教研室、1个公共卫生实验教学中心、5个职能科室、1个山东省高校重点实验室、3个济宁市重点实验室、4个校级科研平台；学院现为中华预防医学会科普宣传基地、山东省全科医生培训基地、公共营养师培训基地、育婴师培训基地、营养指导员定点培训基地。

现有教职工59人，专任教师46人，博士31人，高级职称29人。山东省有突出贡献的中青年专家1人、泰山学者青年专家1人、入选山东省青年科技人才托举工程1人、入选英国皇家生物学会会士1人，山东省青创团队带头人2人，山东省黄大年式教学团队负责人1人，特聘高层次领军人才4人。

近年来，学院承担教育教学课题80余项，发表教学研究论文100余篇，主编国家规划教材5部，获各级教学奖励50余项。学院与国家疾病预防控制中心、中国军事医学科学院、山东省疾病预防控制中心、中国食品工业发酵研究院、韩国全南大学、加拿大达尔豪斯大学等30余个国内外机构共建实践教学基地和研究生培养基地。

研究生教育始于1991年，为山东省最早开展预防医学专业研究生教育的省属高校。30多年来，与同济医科大学（华中科技大学公共卫生学院）、山东大学、华北理工大学等联合培养研究生100余名。2024年获批公共卫生专业硕士授权点，目前研究生在校生70余名。

学院近年承担国家攻关子课题、国家自然基金、山东省自然基金等课题100余项，获得各级奖励90余项，其中获国家级、省部级科研奖励7项。牵头制订国家卫生标准《职业性手臂振动病诊断》的第一版、第二版。近年来在国内外学术期刊上以第一或通讯作者发表论文300余篇，其中中科院二区以上论文70余篇。

学院坚持以教师为主导、以学生为中心的办学理念，坚持教学中心地位，以科研促进教学，构建“教学-科研-实践-服务”四位一体的创新型人才培养体系，大力推进内涵与质量工程建设。预防医学专业应届毕业生年考研录取率均超过50%，年底就业率保持在95%以上。近年来在全国、全省等各级大学生技术技能竞赛中获得100余项奖励。

经过40年的发展，公共卫生学院已经初步形成了人才培养质量较高、教学科研能力较强、社会服务成绩斐然的格局。迄今，已累计为国家和社会培养了4000多名公共卫生专门人才。这些优秀校友构成了山东省各地市公共卫生和预防医学卫生队伍的主体，多人已经成为山东省乃至全国的知名专家、学者，为我国的疾病预防和控制事业做出了突出的贡献。